SEQUENCE ANALYSIS OF FIVE EXONS OF SLC6A4 GENE IN MEXICAN PATIENTS WITH ANOREXIA NERVOSA AND BULIMIA NERVOSA
Antecedentes: La evidencia acumulada indica que las alteraciones en el sistema serotoninérgico están relacionadas con cambios en la conducta alimentaria. El transportador de serotonina está codificado por el gen SLC6A4 y ha sido un candidato interesante para la anorexia nerviosa restrictiva (AN-R) y la bulimia nerviosa (BN). Resulta interesante que se hayan identificado variantes funcionales en la región codificante que podrían contribuir a comprender el papel de este gen en los trastornos de la conducta alimentaria. El objetivo fue identificar variantes genéticas en cinco exones del gen SLC6A4 mediante secuenciación Sanger en pacientes con anorexia nerviosa restrictiva y bulimia nerviosa, y en un grupo control. Método: La muestra consistió en 86 pacientes y 50 sujetos control. Se obtuvieron muestras de ADN de todos los participantes y se realizó el análisis de secuenciación Sanger de los exones 1, 2, 3, 8 y 9. Las secuencias se compararon con la secuencia de referencia del gen SLC6A4. Resultados: El análisis de la secuencia de los cinco exones del gen identificó varias variantes. En el grupo AN-R, se observaron dos variantes nuevas (g.130delA y c.1740G>A), tres variantes sinónimas (rs57172732, rs55908624 y rs74478645) y una variante de cambio de sentido (L90F), que se describe como probablemente deletérea y dañina. En el grupo BN, se identificaron dos variantes nuevas (g.295C>G y c.1725G>A) y la variante no sinónima (rs28914832/I425V), descrita como benigna. Cabe destacar que se observó la variante 425V en tres pacientes con BN, variante que previamente se había descrito en pacientes con un trastorno obsesivo-compulsivo del espectro. Conclusión: Los resultados de nuestro estudio sugieren que las variantes del gen SLC6A4 están relacionadas con una posible alteración o ganancia de función y podrían influir en la susceptibilidad a la anorexia nerviosa restrictiva (AN-R) y la bulimia nerviosa (BN). Sin embargo, estos hallazgos deben considerarse preliminares hasta que se repliquen en muestras de mayor tamaño.
SEQUENCE ANALYSIS OF FIVE EXONS OF SLC6A4 GENE IN MEXICAN PATIENTS WITH ANOREXIA NERVOSA AND BULIMIA NERVOSA
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DOI: 10.37572/EdArt_09122574111
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Palavras-chave: Anorexia Nervosa; Bulimia Nervosa; secuenciación; SLC6A4; gen.
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Keywords: Anorexia Nervosa; Bulimia Nervosa; sequencing; SLC6A4; genetic.
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Abstract:
Background: Accumulating evidence indicates that alterations in the serotonin system are related to changes in eating behavior. The serotonin transporter is encoded by the SLC6A4 gene and has been an interesting candidate for anorexia nervosa- restrictive type (AN-R) and bulimia nervosa (BN). Interestingly, functional variants have been identified in the coding region that could contribute to understand the role of this gene in eating disorders. The aim was to identify genetic variants in five exons of SLC6A4 gene using Sanger-sequencing in anorexia nervosa-restrictive and bulimia nervosa patients, and a control group. Method: The sample consisted of 86 patients and 50 control subjects. We obtained DNA samples from all subjects and performed Sanger-sequence analysis of the 1, 2, 3, 8 and 9 exons. The sequences were compared with the reference sequence of the SLC6A4 gene. Results: The sequence analysis of the five exons of the gene identified several variants. In the AN-R, we observed two novel variants (g.130delA and c.1740G>A), three synonymous variants (rs57172732, rs55908624, rs74478645) and a missense variant (L90F) reporting a probably deleterious and damaging variant. In BN, we identified two novel variants (g.295C>G and c.1725G>A), and the non-synonymous (rs28914832/I425V), reported as benign. Interestingly, we observed the 425V variant in three patients in the BN, variant that previously was reported in patients with a spectrum obsessive-compulsive disorder. Conclusion: The results of our study suggest that variants of the SLC6A4 gene are related with a possible damaging or gain-of-function and may be involved in the susceptibility to AN and BN patients. However, the present findings should be considered as preliminary until replicated in large samples.
- Sandra Hernández Muñoz
- Beatriz Camarena- Medellín
- Laura González-Macías
- Alejandro Azaola-Espinosa
- Mónica Flores Ramos
- Alejandro Caballero Romo